O sistema Janela Única Electrónica (JUE) tem as seguintes vantagens:
- Redução do tempo desembaraço aduaneiro de mercadoria e do custo de operação;
- As operações são realizadas de forma mais rápida e segura com a utilização de computadores, evitando deslocações aos locais aonde estão armazenadas as mercadorias;
- Alterações podem ser feitas rapidamente;
- Permite um aumento da competitividade.